معلومة

بيولوجيا أنظمة تخليق ثلاثي الجلسرين (TAG) في الجاتروفا

بيولوجيا أنظمة تخليق ثلاثي الجلسرين (TAG) في الجاتروفا



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

أحتاج إلى الشبكة التنظيمية الجينية لتوليف TAG (مسار كينيدي) لنبات الجاتروفا ؟؟ أم أن هناك أي طريقة لتحويل المسار الأيضي إلى شبكة تنظيمية وراثية؟


من المحتمل أن يتم الحفاظ على تخليق ثلاثي الجلسرين في النباتات. المسار الأيضي هنا.

تسلسل جينوم الجاتروفا متاح أيضًا.

بالنظر إلى هذا ، تم بذل بعض الجهد لمعرفة كيفية تنظيم هذه الجينات. هذه دراسة ميكروأري لجاتروفا تركز على الأحماض الدهنية والتخليق الحيوي TAG. يعطي هذا فكرة عن كيفية استجابة جينات TAG لبعضها البعض ، ولكن بالطبع لن تجد متواليات المحفز أو عوامل النسخ نفسها.

بعد أن أمضيت الصيف في دراسة تركيب الأحماض الدهنية ، لا يسعني إلا أن أقول إنه كان هناك الكثير من الأعمال المعملية الرطبة التي تم إجراؤها على هذه المسارات والتي من المحتمل أن يتم حفظها في نبات الجاتروفا. سيكون الأدب واسع جدا. إن تكامل كل ذلك أشبه بورقة للنشر أكثر من كونه إجابة على تبادل المكدس. هذا النوع من الخطوط العريضة للإجراء ... هل لديك سؤال أكثر تركيزًا؟

سأحدد طريقة واحدة للتعامل مع هذا - هناك عدد لا يحصى من المتغيرات إذا قمت بتعديلها. هناك طرق أخرى للحصول على هذا ، وأبرزها البحث عن المسوخات المعيبة ، وهي الطريقة التي لا تزال مستخدمة في النباتات كثيرًا.

على أي حال هنا نهج قائم على الجينوم:

1) تحديد الجينات في مسار الاهتمام. اختر 10 أو نحو ذلك من الجينات التي تعتقد أنها تشكل شبكتك. هذا قرار تحريري. في النهاية ، إذا بدأت في النظر إلى الجينات التي تنظمها عوامل النسخ نفسها التي يتم تضمينها في شبكتك ، فستأخذ في النهاية الجينوم بأكمله وسيكون العمل مستحيلًا.

2) البحث عن مواقع ربط المروج المرشح. انظر إلى مناطق المروج المنبع لجميع هذه الجينات. يمكنك أن تنظر في كيفية حفظها بين نباتات متشابهة من خلال فحص نفس المناطق المحركة للجين المحاذية لبعضها البعض. هذا لا يعمل بشكل جيد.

2 ب) هناك طريقة أخرى لإيجاد هذه وهي القيام بـ هدم التجربة حيث ترتبط عوامل النسخ بالحمض النووي ويتم هضم الدنا وتحدد الأجزاء المتبقية مواقع الارتباط. كل هذا يفترض نوعًا ما أنك تعرف نوعًا ما عوامل النسخ المسؤولة عن كل جين. ربما ليس هذا هو الحال هنا.

3) ابحث عن عوامل النسخ المهمة لمسار النبات. هذا ليس بالأمر السهل - إحدى الطرق هي محاولة التخلص من جينات TF. أتخيل أن هذا النبات يحتوي على أكثر من 4000 من هذه الجينات. قد يشارك حوالي 1-2٪.

حتى الآن ، تم استخدام هذه الأساليب في مشروع ENCODE بالإضافة إلى بعض الجينومات البكتيرية. المصنع هو سيناريو جديد سيكون له مشاكل خاصة به.


شاهد الفيديو: #4 Eukaryotes vs Prokaryotes الفرق بين حقيقيات النواة و بدائيات النواة. Biology (أغسطس 2022).