معلومة

ما هي نقطة توقف الحذف القريب؟

ما هي نقطة توقف الحذف القريب؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

أقرأ مقالة في مجلة حول العلاقة بين NCAM2 والتوحد. لقد صادفت البيان التالي في الورقة:

بناءً على التحليل الذي يستخدم متصفح UCSC Genome Browser (hg18 ، build 36) ، هناك ما مجموعه 19 جينًا محذوفًا (الجدول الأول). تقع نقطة توقف الحذف القريبة داخل جين NCAM2 ، مما يؤدي إلى حذف 17 من أصل 18 exons ، ويشتمل الحذف البعيد على 16 exons من أصل 17 exons من جين GRIK1.

لست متأكدًا مما هو المقصود بـ "نقطة توقف الحذف القريبة". لقد حاولت البحث عن التعريف عبر الإنترنت ولكني لم أجد أي شيء مفيد. هي موضع تقدير أي رؤى.


لنفصل العبارة كما ذكر أحد المعلقين:

  • "قريب": في سياق موضع الكروموسومات ، هذا يعني أنه أقرب إلى السنترومير ، في حين أن "القاصي" يعني أبعد من المركز (الجزء الأوسط من الكروموسوم).
  • "الحذف": يشير إلى الجينات التي تم حذفها نتيجة فقدان جزء من الكروموسوم الحادي والعشرين.
  • "نقطة الانهيار": النقاط التي يتم فيها كسر الكروموسومات مما يؤدي إلى الحذف.

بتجميع كل ذلك معًا ، يشير هذا إلى أن نقطة توقف الحذف الأقرب إلى المركز تقع داخل جين NCAM2 ، بينما تقع نقطة توقف الحذف بعيدًا عن المركز ضمن جين GRIK1 ، مع وجود جينات 17/19 الأخرى بين الاثنين.

للتحقق من هذا التفسير ، يمكننا استخدام متصفح USCS Genome كما هو مذكور. يمكننا أن نرى أنه إذا قارنا موضع جين NCAM2 وجين GRIK1 على الكروموسوم الحادي والعشرين ، فإن الأول أقرب إلى السنترومير من الأخير. يمكننا أيضًا إجراء فحص موضعي للتحقق من أن ADAMTS1 أحد الجينات الـ 19 الأخرى المحذوفة ، يقع بين الاثنين.


ما هي نقطة توقف الحذف القريب؟ - مادة الاحياء

نقطة التوقف المرتبطة بحذف جديد بحجم 2.3 ميجا بايت في منطقة VCFS من 22q11 ودور Alu (SINE) في عمليات الحذف الدقيقة المتكررة

المؤلفون

نوع الوثيقة

تاريخ النشر

مجلة

الصوت

مشكلة

الملخص

الخلفية: منطقة الكروموسوم 22q11.2 شديدة التأثر بإعادة الترتيب ، وتحديداً عمليات الحذف التي تؤدي إلى مجموعة متنوعة من الاضطرابات الجينية بما في ذلك سرعة القلب والوجه أو متلازمة دي جورج. الأفراد المصابون بمتلازمة الحذف الصغير 22q11 معرضون بشكل كبير لخطر الإصابة بالفصام.

الطريقة: تم إجراء تحليل النمط الجيني على الحمض النووي لمريض مع حذف دقيق 22q11 باستخدام علامات وراثية ومجموعات أولية مخصصة لتحديد الحذف. تم إجراء تحليل المعلومات الحيوية للتوصيف الجزيئي لتسلسل نقاط توقف الحذف في هذا المريض.

النتائج: تم إنشاء مريض الحذف 22q11 ليكون لديه حذف جديد 2.3 ميجا بايت مع نقطة توقف قريبة تقع بين العلامات الجينية RH48663 و RH48348 ونقطة توقف بعيدة بين العلامات D22S1138 و SHGC-145314. كشف التوصيف الجزيئي للتسلسلات عند نقاط التوقف عن وجود تسلسل مشترك بمقدار 270 نقطة أساس لمناطق نقاط التوقف (SSBR) المشتركة لكلا الطرفين اللذين يشتركان في تشابه تسلسل> 90 ٪ مع بعضهما البعض وأيضًا لعناصر نووية مختصرة / عناصر Alu.

الخلاصة: يكون تسلسل Alu هذا مثل SSBR عادةً بالقرب من جميع نقاط توقف الحذف المعروفة لمنطقة 22q11 وأيضًا في مناطق تكرار النسخ المنخفضة (LCRs). قد يمثل هذا التسلسل تسلسلاً مفضلاً في مناطق نقاط التوقف أو LCRs لآليات إعادة التركيب المتماثل داخل الكروموسومات مما يؤدي إلى حذف 22q11 مشترك.

ملحوظات

نُشر في: BMC Medical Genetics، 2006، 7:18. دوى: 10.1186 / 1471-2350-7-18


خلفية

تعد منطقة 22q11.2 نقطة ساخنة لإعادة الترتيب بسبب عمليات الحذف والتكرار وعمليات النقل. ينتج عن إعادة الترتيب هذه جرعة جينية متغيرة [1] وتؤدي إلى تشوهات خلقية بما في ذلك DiGeorge (DGS MIM 188400) [2] وسرعة القلب (VCFS MIM 192430) [3] و der (22) [4] وعين القط (MIM 115470) ) المتلازمات [5]. أكثر متلازمات الحذف الصغير 22q11.2 شيوعًا هي VCFS / DGS ، والتي تحدث بمعدل تكرار تقديري واحد لكل 4000 ولادة حية [6]. وهو يمثل مجموعة متنوعة من المظاهر السريرية بما في ذلك صعوبات التعلم ، وخصائص مظهر الوجه ، والقصور البلعومي ، والكلام الأنفي المفرط ، والحنك المشقوق ، وعيوب القلب الخلقية [3]. مجموعة فرعية من المرضى المصابين بشدة يعانون أيضًا من نقص التنسج أو غدة الغدة الصعترية وقصور جارات الدرقية مع نقص كالسيوم الدم [2]. تظهر معظم المظاهر السريرية المرتبطة بهذا الاضطراب تعبيرية متغيرة ونفاذًا منخفضًا [1] ، ومع ذلك فإن البالغين المصابين بهذه المتلازمة عادة ما يصابون بأمراض نفسية رئيسية ، خاصة الفصام والاضطراب ثنائي القطب [7-11]. تشترك الغالبية العظمى من المرضى في حذف مشترك يبلغ 3 ميغا بايت. باستثناء بعض الحالات النادرة ، يكون لدى المرضى الباقين عمليات حذف أصغر متداخلة داخل المنطقة المحذوفة عادةً 3 ميجا بايت (TDR) [12].

ترتبط الطبيعة الجزيئية لعمليات إعادة الترتيب المسؤولة عن الحذف الصغير 22q11 بالتركيب الجيني للمنطقة 22q11.2 ، والتي تحتوي على امتدادات طويلة من التسلسلات المتكررة المجمعة معًا ، والمعروفة باسم تكرار النسخ المنخفضة (LCRs) لـ & gt95٪ هوية [13 ، 14 ]. تم الإبلاغ عن LCRs الخاصة بالكروموسوم 22 عند أو بالقرب من نقاط التوقف الخاصة بـ 3 ميجا بايت TDR التي تؤثر على حذف DGS / VCFS على 22q11.2 [15-20]. ومن المعروف أنها تتوسط أحداث إعادة التركيب المتماثل غير الأليلات غير المتكافئة وتساهم في إعادة الترتيب المرتبطة بالاضطرابات الجينية [21-23]. ومن المثير للاهتمام ، أنه ليست كل LCRs من 22q11 تبدو فعالة بنفس القدر في التسبب في الحذف الصغير وهي تختلف فيما يتعلق ببعض تسلسلاتها. علاوة على ذلك ، تحتوي LCRs على عناصر متكررة للغاية مثل العناصر النووية القصيرة (SINEs) والعناصر النووية الطويلة المتناثرة (LINEs). وقد تورطت هذه العناصر ، ولا سيما SINEs في إعادة ترتيب الكروموسومات والمرض [24]. تم أيضًا إنشاء عناصر Alu ، وهي جزء من عائلة SINE من العناصر القابلة للنقل [24] ، باعتبارها تلعب دورًا في تعديل بنية الجينوم البشري بالاقتران مع الاضطرابات البشرية وفي التوسط في إعادة ترتيب الجينات [25 ، 26]. لذلك من المهم تقييم طبيعة عناصر Alu المرتبطة بـ LCRs الفردية في عمليات الحذف الصغيرة الجديدة.

في هذه الورقة ، قمنا بالإبلاغ عن نتيجة دراسة حالة حيث قمنا بتمييز منطقة الحذف في مريض VCFS. لقد حددنا حذفًا جديدًا 2.3 ميجا بايت في منطقة الكروموسوم 22q11.2 في المريض. لقد قمنا أيضًا بتحليل التسلسلات عند نقطتي التوقف لعناصر محتملة مثل Alu وحددنا تسلسلًا مشتركًا لمناطق نقاط التوقف (SSBR) التي قد تهيئ هذه المنطقة للحذف الصغير.


الحذف والازدواجية القريبة من ملف خارجي 1 الجين: آلية مسببة جديدة للعظم الغضروفي المتعدد †

بدعم من: المنظمة الهولندية للبحث العلمي ، رقم المنحة: 917-76-315 (إلى CJFW و CMAR و JVMGB) الشبكة الأوروبية للتميز EuroBoNet ، رقم المنحة: 018814 (LSHC-CT-2006-018814) (إلى CJFW ، MGTW و DdJ و JVMGB و KS).

تسجيل الدخول المؤسسي
قم بتسجيل الدخول إلى مكتبة Wiley Online

إذا كنت قد حصلت مسبقًا على حق الوصول باستخدام حسابك الشخصي ، فيرجى تسجيل الدخول.

شراء الوصول الفوري
  • شاهد المقال بصيغة PDF وأي ملاحق وأرقام مرتبطة به لمدة 48 ساعة.
  • المادة يمكن ليس أن تتم طباعتها.
  • المادة يمكن ليس يمكن تنزيلها.
  • المادة يمكن ليس يتم إعادة توزيعها.
  • عرض غير محدود لمقال PDF وأي ملاحق وأرقام مرتبطة به.
  • المادة يمكن ليس أن تتم طباعتها.
  • المادة يمكن ليس يمكن تنزيلها.
  • المادة يمكن ليس يتم إعادة توزيعها.
  • عرض غير محدود للمقال / الفصل PDF وأي ملاحق وأرقام مرتبطة.
  • يمكن طباعة المقال / الفصل.
  • يمكن تحميل المادة / الفصل.
  • المادة / الفصل يمكن ليس يتم إعادة توزيعها.

الملخص

العظمية الغضروفية المتعددة (MO) هي متلازمة تتطور فيها الأورام الحميدة المغطاة بالغضروف على سطح العظام الطويلة. معظم الحالات ناتجة عن تغييرات خارجية في خارجي 1 أو EXT2، لكن 15٪ سلبيون لهذه التغييرات. هنا نبلغ للمرة الأولى عن عائلة من مرضى MO يعانون من تغيرات جينومية في السلالة الجرثومية في خارجي 1 الموقع دون حدوث طفرات يمكن اكتشافها أو تغييرات في عدد النسخ تحويلة متواليات exonic. أظهر Array-CGH حذف 80.7 كيلو بايت من Intron 1 من خارجي 1 و 68.9 كيلوبايت القريبة من الازدواجية خارجي 1. حددنا نقطة توقف بين النهاية البعيدة للمنطقة المكررة والتسلسل البعيد للمنطقة المحذوفة في الإنترون الأول. كانت نقطة التوقف هذه غائبة في أفراد الأسرة غير المتأثرين. يشير تكوين نقطة التوقف إلى إدخال مباشر للمنطقة المكررة في الحذف. ومع ذلك ، لم يتم العثور على نقطة توقف أخرى ، مما يشير إلى حدوث إعادة ترتيب جيني أكثر تعقيدًا داخل المنطقة المكررة. تكشف نتائجنا عن الحذف والازدواج الداخلي كآلية مسببة جديدة للـ MO الذي لم يتم اكتشافه بواسطة طرق التشخيص التقليدية. © 2013 Wiley Periodicals، Inc.


محتويات

تتميز متلازمة 5q بفقر الدم الكبير ، وغالبًا ما تكون كثرة الصفيحات المعتدلة ، قلة الكريات الحمر ، تضخم خلايا النواء مع نقص الخلايا النووية ، وحذف خلالي معزول للكروموسوم 5. توجد متلازمة 5q في الغالب في الإناث في سن متقدمة. [2]

يبدو أن العديد من الجينات في المنطقة المحذوفة تلعب دورًا في التسبب في متلازمة 5q. [3] [4] يلعب Haploinsufficiency of RPS14 دورًا مركزيًا ، ويساهم في فقر الدم من خلال تأثيرات مثبط الورم المعتمد على p53 والمستقل عن p53. [4] تشمل الجينات الأخرى في هذه المنطقة miR-145 و miR-146a ، والتي يرتبط حذفها بخلل التنسج الضخم وكثرة الصفيحات في متلازمة 5q [5] SPARC ، والتي لها تأثيرات مضادة للتكاثر ومضادة لتكوّن الأوعية ومثبطات الورم المرشحة EGR1 ، CTNNA1 و CDC25C. [4]

تؤثر هذه المتلازمة على خلايا نخاع العظام مسببة فقر الدم المقاوم للعلاج ومتلازمات خلل التنسج النقوي التي قد تؤدي إلى ابيضاض الدم النقوي الحاد. يُظهر فحص نخاع العظم تغيرات مميزة في خلايا النواء. هم أكثر عددا من المعتاد ، صغيرة وحيدة النواة. قد يكون هناك نقص تنسج الكريات الحمر مصاحبًا في نخاع العظم. [6]

ليناليدوميد له نشاط في متلازمة 5q [7] وهو معتمد من إدارة الأغذية والعقاقير لفقر الدم المعتمد على نقل خلايا الدم الحمراء (RBC) بسبب متلازمة خلل التنسج النخاعي منخفضة أو متوسطة (int-1) المرتبطة بحذف الكروموسوم 5q مع أو بدون تشوهات خلوية إضافية. [8] هناك العديد من الآليات المحتملة التي تربط الآفات الجزيئية لنقص الويندوز بحساسية الليناليدوميد. [4] [9]

معظم الأشخاص المصابين لديهم مسار سريري مستقر ولكنهم يعتمدون في الغالب على نقل الدم. [ بحاجة لمصدر ]


رسم الخرائط الجزيئية لنقاط توقف الحذف على الكروموسوم 4 من ذبابة الفاكهة سوداء البطن

كجزء من جهودنا للحث والتعرف على الطفرات في جميع الجينات على الكروموسوم 4 من ذبابة الفاكهة سوداء البطن، لقد قمنا بتعيين نقاط توقف ثمانية كروموسوم 4 أوجه القصور المتعلقة بالجينات المتوقعة على طول هذا الكروموسوم. على الرغم من أن المواقع التقريبية لـ دي اف (4), دي اف (4) سي 3, مدافع (4) M101-62f, Df (4) M101-63a, دي اف (4) جي 2, دي اف (4) O2, Df (4) C1-10AT، و Df (4) B2-2D معروفة (بعضها من الملاحظات الخلوية والبعض الآخر تنبأ من ص مواقع العناصر) ، لم يتم تعيين نطاقات عمليات الحذف هذه فيما يتعلق بالجينات المتوقعة التي تم تحديدها بواسطة مشروع جينوم ذبابة الفاكهة. تم تصميم بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل لتضخيم exons المتوقعة لكل الكروموسوم 4 تم تحديد الجينات والأجنة متماثلة اللواقح لكل نقص واستخدام الحمض النووي الخاص بهم لاختبار وجود أو عدم وجود هذه الإكسونات. من خلال اختبار عدم القدرة على تضخيم exons المختلفة على طول الكروموسوم ، تمكنا من تحديد الجينات المتوقعة المفقودة في كل نقص. العيوب الخمسة ، دي اف (4), دي اف (4) سي 3, Df (4) C1-10AT، و مدافع (4) B2-20 (جميع عمليات الحذف النهائية) ، و مدافع (4) M101-62f (حذف خلالي قريب) ، مكننا من تقسيم الذراع اليمنى المحتوية على الجين للكروموسوم 4 في خمس مناطق. المنطقة أ [تم الكشف عنها بواسطة مدافع (4) M101-62f] يحتوي على 21 جينًا قريبًا من المنطقة B [التي تم الكشف عنها بواسطة Df (4) B2-2D] يحتوي على المنطقة الجينية الـ 12 التالية [التي تم الكشف عنها بواسطة Df (4) B2-2D و Df (4) C1-10AT] يحتوي على المنطقة الجينية الـ 17 التالية [التي تم الكشف عنها بواسطة Df (4) B2-2D, Df (4) C1-10AT، و دي اف (4) سي 3] يحتوي على الجينات الـ 21 التالية والمنطقة E [التي تم الكشف عنها بواسطة Df (4) B2-2D, Df (4) C1-10AT, دي اف (4) سي 3، و دي اف (4)] يحتوي على أكثر عشرة جينات بعيدة. باستخدام مدافع (4) M101-62f, Df (4) B2-2D, Df (4) C1-10AT, دي اف (4) سي 3، و دي اف (4) في اختبارات التكميل ، يمكننا تعيين طفرات مميتة متنحية مستحثة حديثًا إلى إحدى المناطق الخمس على الكروموسوم 4. سيؤدي هذا إلى تقليل مقدار تحليل DHPLC المطلوب بشكل كبير لمطابقة كل طفرة مع نسخة متوقعة على الكروموسوم 4.

هذه معاينة لمحتوى الاشتراك ، والوصول عبر مؤسستك.


ابيضاض الدم النخاعي الحاد (AML) المرتبط بانقلاب في الكروموسوم 16 له توقعات مواتية نسبيًا. الفئة الفرعية من AML المرتبطة بشكل شائع بهذا الشذوذ الكروموسومي هي ابيضاض الدم النخاعي الحاد مع الحمضات غير الطبيعية. في بعض مرضى AML الذين يعانون من الانقلاب 16 ، تؤدي الآفة الصبغية إلى حذف MRP ، وهو جين البروتين المرتبط بمقاومة الأدوية المتعددة. هذا الجين قريب من نقطة التوقف الأولية وقد يلعب فقدان وظيفته دورًا رئيسيًا في تحديد النتيجة الإيجابية في انعكاس 16 AML. لقد أظهرنا حذف MRP عن طريق التهجين في الموقع ، ودراسات جرعة الجينات ودراسة فقدان عدم تجانس علامة الأقمار الصناعية الدقيقة المحيطة. من بين 13 مريضًا من مرضى AML الذين يعانون من الانعكاس ، تم اكتشاف حذف 16 MRP في 5 بينما لم يتم حذف 7. ارتبط حذف جين MRP بوقت أطول من التشخيص حتى الموت أو الانتكاس من مغفرة كاملة (ع = 0 · 007). توفر هذه النتائج نظرة ثاقبة مهمة في بيولوجيا الانعكاس 16 ابيضاض الدم وتشير إلى أن حذف MRP ، كما تم الكشف عنه من خلال التحليل الجزيئي ، قد يكون له دور رئيسي في تحديد النتيجة في المرضى الذين يعانون من انقلاب 16 AML.

  • APA
  • مؤلف
  • BIBTEX
  • هارفارد
  • اساسي
  • RIS
  • فانكوفر

حذف الجين لمقاومة الأدوية المتعددة في ابيضاض الدم النخاعي الحاد مع انعكاس في الكروموسوم 16: الآثار النذير. / Kuss، B. J. Eyre، H.J Lane، S.A Nancarrow، J.K Whitmore، S.A Callen، D.F Deeley، R.G Cole، Susan P.C Willman، C.L Kopecky، K. L. Willman، C.L Kopecky، Kj Wolman، S.R Willman، C.L Kopecky، Kj Wolman، S.R.

في: لانسيت ، المجلد. 343 ، رقم 8912 ، 18.06.1994 ، ص. 1531-1534.

مخرجات البحث: المساهمة في المجلة ›المقال› مراجعة الأقران

T1 - حذف الجين لمقاومة الأدوية المتعددة في ابيضاض الدم النخاعي الحاد مع انعكاس في الكروموسوم 16

T2 - الآثار النذير

N2 - ابيضاض الدم النخاعي الحاد (AML) المرتبط بانقلاب في الكروموسوم 16 له تكهن مواتٍ نسبيًا. الفئة الفرعية من AML المرتبطة بشكل شائع بهذا الشذوذ الكروموسومي هي ابيضاض الدم النخاعي الحاد مع الحمضات غير الطبيعية. في بعض مرضى AML الذين يعانون من الانقلاب 16 ، تؤدي الآفة الصبغية إلى حذف MRP ، وهو جين البروتين المرتبط بمقاومة الأدوية المتعددة. هذا الجين قريب من نقطة التوقف الأولية وقد يلعب فقدان وظيفته دورًا رئيسيًا في تحديد النتيجة الإيجابية في انعكاس 16 AML. لقد أظهرنا حذف MRP عن طريق التهجين في الموقع ، ودراسات جرعة الجينات ودراسة فقدان عدم تجانس علامة الأقمار الصناعية الدقيقة المحيطة. من بين 13 مريضًا من مرضى AML الذين يعانون من الانعكاس ، تم اكتشاف حذف 16 MRP في 5 بينما لم يتم حذف 7. ارتبط حذف جين MRP بوقت أطول من التشخيص حتى الموت أو الانتكاس من مغفرة كاملة (ع = 0 · 007). توفر هذه النتائج نظرة ثاقبة مهمة في بيولوجيا الانعكاس 16 ابيضاض الدم وتشير إلى أن حذف MRP ، كما تم الكشف عنه من خلال التحليل الجزيئي ، قد يكون له دور رئيسي في تحديد النتيجة في المرضى الذين يعانون من انعكاس 16 AML.

AB - ابيضاض الدم النخاعي الحاد (AML) المرتبط بانقلاب في الكروموسوم 16 له توقعات مواتية نسبيًا. الفئة الفرعية من AML المرتبطة بشكل شائع بهذا الشذوذ الكروموسومي هي ابيضاض الدم النخاعي الحاد مع الحمضات غير الطبيعية. في بعض مرضى AML الذين يعانون من الانقلاب 16 ، تؤدي الآفة الصبغية إلى حذف MRP ، وهو جين البروتين المرتبط بمقاومة الأدوية المتعددة. هذا الجين قريب من نقطة التوقف الأولية وقد يلعب فقدان وظيفته دورًا رئيسيًا في تحديد النتيجة الإيجابية في انعكاس 16 AML. لقد أظهرنا حذف MRP عن طريق التهجين في الموقع ، ودراسات جرعة الجينات ودراسة فقدان عدم تجانس علامة الأقمار الصناعية الدقيقة المحيطة. من بين 13 مريضًا من مرضى AML الذين يعانون من الانعكاس ، تم اكتشاف حذف 16 MRP في 5 بينما لم يتم حذف 7. ارتبط حذف جين MRP بوقت أطول من التشخيص حتى الموت أو الانتكاس من مغفرة كاملة (ع = 0 · 007). توفر هذه النتائج نظرة ثاقبة مهمة في بيولوجيا الانعكاس 16 ابيضاض الدم وتشير إلى أن حذف MRP ، كما تم الكشف عنه من خلال التحليل الجزيئي ، قد يكون له دور رئيسي في تحديد النتيجة في المرضى الذين يعانون من انعكاس 16 AML.


مراجع

van den Berg H، Kroon HM، Slaar A، Hogendoorn P: حدوث أورام عظام مثبتة بالخزعة عند الأطفال: تقرير يعتمد على تسجيل علم الأمراض الهولندي "PALGA". مجلة جراحة عظام الأطفال. 2008 ، 28 (1): 29-35. 10.1097 / BPO.0b013e3181558cb5.

Hennekam RCM: توارث متعددة وراثية. J ميد جينيت. 1991 ، 28: 262-266. 10.1136 / جم 28.4.262.

Schmale GA ، Conrad EU ، Raskind WH: التاريخ الطبيعي للإكراهات المتعددة الوراثية. J Bone Joint Surg Br. 1994 ، 76 (أ): 986-992.

Bovée J ، Hogendoorn P: العظم العظمي الغضروفي المتعدد. تصنيف منظمة الصحة العالمية للأورام علم الأمراض وعلم الوراثة لأورام الأنسجة الرخوة والعظام. تحرير: Fletcher C، Unni K، Mertens F. 2002، Lyon: IARC Press، 360-362.

سولومون ل: تكاثر وراثي متعدد. J Bone Joint Surg (Br). 1963 ، 45: 292-304.

Luckert Wicklund C ، Pauli RM ، Johnston D ، Hecht JT: دراسة التاريخ الطبيعي للخروج الوراثي المتعدد. أنا J ميد جينيت. 1995 ، 55: 43-46. 10.1002 / ajmg.1320550113.

Ahn J، Lüdecke H، Lindow S، Horton WA، Lee B، Wagner MJ، Horsthemke B، Wells DE: استنساخ الجين المفترض لقمع الورم من أجل الإكراهات المتعددة الوراثية (EXT1). علم الوراثة الطبيعي. 1995 ، 11: 137-143. 10.1038 / نغ 1095-137.

Stickens D ، و Clines G ، و Burbee D ، و Ramos P ، و Thomas S ، و Hogue D ، و Hecht JT ، و Lovett M ، و Evans GA: يحدد الجين EXT2 المضاعف عائلة من الجينات المفترضة لقمع الورم. طبيعة الجينات. 1996 ، 14: 25-32. 10.1038 / ng0996-25.

Wuyts W، Van Hul W، Wauters J، Nemtsova M، Reyniers E، Van Hul E، De Boulle K، de Vries BBA، Hendrickx J، Herrygers I، Bossuyt P، Balemans W، Fransen E، Vits L، Coucke P، Nowak NJ، Shows TB، Mallet L، van den Ouweland AMW، McGaughran J، Halley DJJ، Willems PJ: الاستنساخ الموضعي للجين المتورط في الإكراه الوراثي المتعدد. علم الوراثة الجزيئية البشرية. 1996 ، 5 (10): 1547-1557. 10.1093 / ساعة ملجم / 5.10.1547.

Lüdecke H-J و Ahn J و Lin X و Hill A و Wagner MJ و Schomburg L و Horsthemke B و Wells DE: التنظيم الجينومي والبنية المحركة للجين البشري EXT1. علم الجينوم. 1997 ، 40: 351-354. 10.1006 / جينو.1996.4577.

Clines GA، Ashley JA، Shah S، Lovett M: هيكل الإنسان المتعدد يفسد الجينين وتوصيف المتماثلات في الفأر و caenorhabditis elegans. أبحاث الجينوم. 1997 ، 7: 359-367.

Bovée J ، Cleton-Jansen A ، Wuyts W ، Caethoven G ، Taminiau A ، Bakker E ، Van Hul W ، Cornelisse P ، Hogendoorn P: تحليل الطفرات الخارجية وفقدان الزيجوت غير المتجانسة في العظام المتقطعة والوراثية والساركوما الغضروفية الثانوية. AmJHumGenet. 1999 ، 65: 689-698.

Jones KB ، Piombo V ، Searby C ، Kurriger G ، Yang B ، Grabellus F ، Roughley PJ ، Morcuende JA ، Buckwalter JA ، Capecchi MR ، Vortkamp A ، Sheffield VC: نموذج فأر لتكوين عظم غضروفي من تعطيل نسيلي لـ Ext1 في الخلايا الغضروفية. وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية. 2010 ، 107 (5): 2054-2059. 10.1073 / pnas.0910875107.

Jennes I و Pedrini E و Zuntini M و Mordenti M و Balkassmi S و Asteggiano CG و Casey B و Bakker B و Sangiorgi L و Wuyts W: osteochondromas المتعددة: تحديث الطفرة ووصف لقاعدة بيانات طفرة عظمية غضروفية متعددة (MOdb). طفرة بشرية. 2009 ، 30 (12): 1620-1627. 10.1002 / humu.21123.

White SJ ، Vink GR ، Kriek M ، Wuyts W ، Schouten J ، Bakker B ، Breuning MH ، den Dunnen JT: تضخيم مسبار متعدد الألوان يعتمد على الربط: الكشف عن إعادة الترتيب الجينومي في الإكراهات المتعددة الوراثية. طفرة بشرية. 2004 ، 24 (1): 86-92. 10.1002 / humu.20054.

Jennes I و Entius MM و Van Hul E و Parra A و Sangiorgi L و Wuyts W: فحص الطفرات في EXT1 و EXT2 عن طريق تغيير طبيعة الكروماتوغرافيا السائلة عالية الأداء وتحليل التسلسل المباشر والفلورة في التهجين الموضعي ومسبار جديد يعتمد على الربط المتعدد مجموعة مسبار التضخيم في المرضى الذين يعانون من عظام غضروفي متعدد. J مول تشخيص. 2008 ، 10 (1): 85-92. 10.2353 / jmoldx.2008.070086.

Chen JM و Cooper DN و Ferec C و Kehrer-Sawatzki H و Patrinos GP: إعادة ترتيب الجينوم في الأمراض الوراثية والسرطان. ندوات في بيولوجيا السرطان. 20 (4): 222-233.

Hall BD ، Langer LO ، Giedion A ، Smith DW ، Cohen MM ، Beals RK ، Brandner M: متلازمة لانجر-جيديون. سلسلة مقالات العيوب الخلقية الأصلية. 1974 ، 10 (12): 147-164.

Lüdecke HJ، Wagner MJ، Nardmann J، La Pillo B، Parrish JE، Willems PJ، Haan EA، Frydman M، Hamers GJH، Wells DE، Horsthemke B: التشريح الجزيئي لمتلازمة الجين المتجاورة: توطين الجينات المشاركة في لانجر - متلازمة الجيدون. علم الوراثة الجزيئية البشرية. 1995 ، 4 (1): 31-36. 10.1093 / ساعة ملجم / 4.1.31.

Bartsch O، Wuyts W، Van Hul W، Hecht JT، Meinecke P، Hogue D، Werner W، Zabel B، Hinkel GK، Powell CM، Shaffer LG، Willems PJ: توصيف متلازمة الجين المتجاورة مع تفرعات متعددة ، ثقب جداري متضخم ، خلل التنسج القحفي الوجهي والتخلف العقلي ، الناجم عن الحذف على الذراع القصيرة للكروموسوم 11. المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية. 1996 ، 58: 734-742.

Romeike BF ، Wuyts W: النمط الظاهري لمتلازمة حذف الجينات المتجاورة للكروموسوم القريب 11p: تقرير حالة ومراجعة الأدبيات. أمراض الأعصاب السريرية. 2007 ، 26 (1): 1-11.

Szuhai K ، Jennes I ، de Jong D ، Bovee JV ، Wiweger M ، Wuyts W ، Hogendoorn PC: يُظهر Tiling Resolution array-CGH أن حذف الفسيفساء الجسدي للجين EXT مسبب في طفرة الجين EXT السلبية المتعددة لمرضى العظام الغضروفية المتعددة. طفرة بشرية. 32 (2): E2036-2049.

Abeysinghe SS ، Chuzhanova N ، Krawczak M ، Ball EV ، Cooper DN: نقاط توقف الانتقال والحذف الإجمالي في الأمراض والسرطان البشرية الموروثة: تكوين النيوكليوتيدات والأشكال المرتبطة بإعادة التركيب. طفرة بشرية. 2003 ، 22 (3): 229-244. 10.1002 / humu.10254.

ليبر إم آر: آلية انضمام نهاية الحمض النووي البشري غير المتماثل. مجلة الكيمياء البيولوجية. 2008 ، 283 (1): 1-5.

Ma JL و Kim EM و Haber JE و Lee SE: تحدد بروتينات الخميرة Mre11 و Rad1 آلية مستقلة عن Ku لإصلاح الفواصل المزدوجة التي تفتقر إلى تسلسلات النهاية المتداخلة. البيولوجيا الجزيئية والخلوية. 2003 ، 23 (23): 8820-8828. 10.1128 / MCB.23.23.8820-8828.2003.

McVey M ، Lee SE: إصلاح MMEJ للكسر المزدوج (قطع المخرج): التسلسلات المحذوفة والنهايات البديلة. اتجاهات الجينات. 2008 ، 24 (11): 529-538. 10.1016 / j.tig.2008.08.007.

Hastings PJ ، Ira G ، Lupski JR: نموذج النسخ المتماثل الناجم عن الكسر بوساطة علم الأحياء الدقيقة لأصل تباين رقم النسخة البشرية. علم الوراثة PLoS. 2009 ، 5 (1): e1000327-10.1371 / journal.pgen.1000327.

Zucman-Rossi J و Legoix P و Der Sarkissian H و Cheret G و Sor F و Bernardi A و Cazes L و Giraud S و Ollagnon E و Lenoir G و Thomas G: جين NF2 في مرضى الورم الليفي العصبي من النوع 2. علم الوراثة الجزيئية البشرية. 1998 ، 7 (13): 2095-2101. 10.1093 / hmg / 7.13.2095.

van Zelm MC، Geertsema C، Nieuwenhuis N، de Ridder D، Conley ME، Schiff C، Tezcan I، Bernatowska E، Hartwig NG، Sanders EA، Litzman J، Kondratenko I، van Dongen JJ، van der Burg M: IGHM أو BTK أو Artemis: نموذج للآفات الجينية بوساطة عناصر قابلة للتحويل. الصحيفة الامريكية لجينات الانسان. 2008 ، 82 (2): 320-332. 10.1016 / j.ajhg.2007.10.011.

Deininger PL، Batzer MA: يكرر ألو والمرض البشري. علم الوراثة الجزيئية والتمثيل الغذائي. 1999 ، 67 (3): 183-193. 10.1006 / mgme.1999.2864.

DeCerbo J ، Carmichael GG: تشير SINEs إلى التحرير الوفير في الجينوم البشري. بيولوجيا الجينوم. 2005، 6 (4): 216-10.1186 / gb-2005-6-4-216.

Weiner AM، Deininger PL، Efstratiadis A: retroposons غير فيروسية: الجينات ، الجينات الخادعة ، والعناصر القابلة للنقل الناتجة عن التدفق العكسي للمعلومات الجينية. المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية. 1986 ، 55: 631-661. 10.1146 / annurev.bi.55.070186.003215.

Hasler J ، Samuelsson T ، Strub K: "خردة" مفيدة: Alu RNAs في نسخة الإنسان. علوم الحياة مول الخلية. 2007 ، 64 (14): 1793-1800. 10.1007 / s00018-007-7084-0.

Shaw CJ ، Lupski JR: آثار بنية الجينوم البشري على الاضطرابات القائمة على إعادة الترتيب: الأساس الجيني للمرض. علم الوراثة الجزيئية البشرية. 2004 ، 13 (المواصفات رقم 1): R57-64.

de Smith AJ و Tsalenko A و Sampas N و Scheffer A و Yamada NA و Tsang P و Ben-Dor A و Yakhini Z و Ellis RJ و Bruhn L و Laderman S و Froguel P و Blakemore AI: يحدد تحليل Array CGH لتغير رقم النسخ 1284 جينًا جديدًا متغيرًا لدى الذكور البيض الأصحاء: الآثار المترتبة على دراسات الارتباط للأمراض المعقدة. علم الوراثة الجزيئية البشرية. 2007 ، 16 (23): 2783-2794. 10.1093 / hmg / يوم 208.

سين سك ، هان ك ، وانغ جي ، لي جي ، وانغ إتش ، كالينان بي إيه ، داير إم ، كوردوكس آر ، ليانج بي ، باتزر إم إيه: عمليات الحذف الجينومي البشري بوساطة إعادة التركيب بين عناصر ألو. الصحيفة الامريكية لجينات الانسان. 2006 ، 79 (1): 41-53. 10.1086 / 504600.

Han K و Lee J و Meyer TJ و Wang J و Sen SK و Srikanta D و Liang P و Batzer MA: عمليات الحذف الهيكلية التي تتم بوساطة إعادة التركيب في جينوم الشمبانزي. علم الوراثة PLoS. 2007 ، 3 (10): 1939-1949.

لاندر إس ، لينتون إل إم ، بيرين ب ، نوسباوم سي ، زودي إم سي ، بالدوين جي ، ديفون ك ، ديوار ك ، دويل إم ، فيتزهيو دبليو ، فونكي آر ، كايج دي ، هاريس ك ، هيفورد أ ، هاولاند جي ، كان إل ، ليوتشكي جي و LeVine R و McEwan P و McKernan K و Meldrim J و Mesirov JP و Miranda C و Morris W و Naylor J و Raymond C و Rosetti M و Santos R و Sheridan A و Sougnez C و Stange-Thomann N و Stojanovic N و Subramanian A ، Wyman D، Rogers J، Sulston J، Ainscough R، Beck S، Bentley D، Burton J، Clee C، Carter N، Coulson A، Deadman R، Deloukas P، Dunham A، Dunham I، Durbin R، French L، Grafham D، Gregory S، Hubbard T، Humphray S، Hunt A، Jones M، Lloyd C، McMurray A، Matthews L، Mercer S، Milne S، Mullikin JC، Mungall A، Plumb R، Ross M، Shownkeen R، Sims S، Waterston RH، Wilson RK، Hillier LW، McPherson JD، Marra MA، Mardis ER، Fulton LA، Chinwalla AT، Pepin KH، Gish WR، Chissoe SL، Wendl MC، Delehaunty KD، Miner TL، Delehaunty A، Kramer JB، Cook LL و Fulton RS و Johnson DL و Minx PJ و Clifton SW و Hawkins T و Branscomb E و Predki P و Richardson P و Wenning S و S lezak T، Doggett N، Cheng JF، Olsen A، Lucas S، Elkin C، Uberbacher E، Frazier M، Gibbs RA، Muzny DM، Scherer SE، Bouck JB، Sodergren EJ، Worley KC، Rives CM، Gorrell JH، Metzker ML ، Naylor SL، Kucherlapati RS، Nelson DL، Weinstock GM، Sakaki Y، Fujiyama A، Hattori M، Yada T، Toyoda A، Itoh T، Kawagoe C، Watanabe H، Totoki Y، Taylor T، Weissenbach J، Heilig R، Saurin W، Artiguenave F، Brottier P، Bruls T، Pelletier E، Robert C، Wincker P، Smith DR، Doucette-Stamm L، Rubenfield M، Weinstock K، Lee HM، Dubois J، Rosenthal A، Platzer M، Nyakatura G، Taudien S، Rump A، Yang H، Yu J، Wang J، Huang G، Gu J، Hood L، Rowen L، Madan A، Qin S، Davis RW، Federspiel NA، Abola AP، Proctor MJ، Myers RM، Schmutz J، ديكسون إم ، غريموود جي ، كوكس دي آر ، أولسون إم في ، كاول آر ، ريمون سي ، شيميزو إن ، كاواساكي ك ، مينوشيما إس ، إيفانز جي إيه ، أثاناسيو إم ، شولتز آر ، رو بي إيه ، تشين إف ، بان إتش ، رامسر جي ، ليهراش إتش ، رينهاردت آر ، مكومبي دبليو آر ، دي لا باستيد إم ، ديديا إن ، بلوكير إتش ، هورنشر ك ، نورديك جي ، أغاروالا آر ، أرافيند إل ، با iley JA، Bateman A، Batzoglou S، Birney E، Bork P، Brown DG، Burge CB، Cerutti L، Chen HC، Church D، Clamp M، Copley RR، Doerks T، Eddy SR، Eichler EE، Furey TS، Galagan J ، Gilbert JG، Harmon C، Hayashizaki Y، Haussler D، Hermjakob H، Hokamp K، Jang W، Johnson LS، Jones TA، Kasif S، Kaspryzk A، Kennedy S، Kent WJ، Kitts P، Koonin EV، Korf I، Kulp D و Lancet D و Lowe TM و McLysaght A و Mikkelsen T و Moran JV و Mulder N و Pollara VJ و Ponting CP و Schuler G و Schultz J و Slater G و Smit AF و Stupka E و Szustakowski J و Thierry-Mieg D و Thierry -Mieg J، Wagner L، Wallis J، Wheeler R، Williams A، Wolf YI، Wolfe KH، Yang SP، Yeh RF، Collins F، Guyer MS، Peterson J، Felsenfeld A، Wetterstrand KA، Patrinos A، Morgan MJ، de Jong P ، Catanese JJ ، Osoegawa K ، Shizuya H ، Choi S ، Chen YJ: التسلسل الأولي وتحليل الجينوم البشري. طبيعة سجية. 2001 ، 409 (6822): 860-921. 10.1038 / 35057062.

تاريخ ما قبل النشر

يمكن الوصول إلى تاريخ ما قبل النشر لهذه الورقة هنا:


تقرير الحالة

وُلد مريضتنا في الأسبوع الثلاثين من الحمل عن طريق الولادة المهبلية في قمة الرأس. كان وزنها 1531 جم وطولها 40 سم. تم الإبلاغ عن مشاكل النزيف أثناء الحمل ولكن لم يكن هناك حاجة إلى الدخول إلى المستشفى. لوحظ انخفاض نشاط الجنين. لوحظ نقص التوتر ورد فعل مص ضعيف مع صعوبات في التغذية بعد فترة وجيزة من الولادة. أظهرت دراسات الكروموسوم حذف الكروموسوم النموذجي 15q11-q13 الذي أكده التألق في التهجين الموضعي باستخدام مجسات لـ SNRPNو D15S11 و جبر 3. بالإضافة إلى ذلك ، تم تشخيص اختبار مثيلة تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) لـ PWS. تاريخياً ، كانت لديها السمات النموذجية التي شوهدت في متلازمة برادر ويلي بما في ذلك الجبهة الضيقة ، والأنف الصغير المقلوب ، والفم المنكمش ، ونقص التوتر ، وصغر اليدين والقدمين ، والسمنة في مرحلة الطفولة المبكرة ، ومشاكل التعلم والسلوك ، وانتقاء الجلد. كانت تعاني أيضًا من نقص تصبغ فيما يتعلق بأفراد الأسرة الآخرين ، وعادة ما تظهر في أولئك الذين لديهم حذف 15q11-q13. 13 ، 20 لم تكن مصابة بداء السكري وخضعت لاختبارات لوظائف الغدة الدرقية بشكل طبيعي في الماضي على الرغم من أن لديها تاريخ طويل من السمنة. لديها تاريخ من أنماط الأكل غير العادية مع فرط الأكل والبحث عن الطعام مما يؤدي إلى السمنة في مرحلة الطفولة المبكرة. الثلاجة وخزائن المطبخ مقفلة في بيئة المنزل. لم تعاني من توقف التنفس أثناء النوم ولكنها تعاني من النعاس. في السابعة عشرة من عمرها ، كان وزنها 98.9 كجم (& GT & GT 97th المئوية) وكان طولها 149.9 سم (الشريحة الثالثة). لم يتم علاجها بأدوية نفسية على الرغم من وجود مشاكل سلوكية بما في ذلك مص الجلد في مرحلة الطفولة المبكرة. كانت تعاني من تأخر في النمو وتأخر عقلي خفيف. كان لديها تاريخ من صعوبات القراءة والرياضيات التي تتطلب تعليمًا خاصًا وعلاجًا للنطق. تستمتع بالسباحة لكنها لا تحب ركوب الدراجة أو المشي أو الرقص. إنها تستمتع بالعمل مع الحرف اليدوية وألغاز الصور المقطوعة.

أظهر تحليل الأقمار الصناعية باستخدام PCR باستخدام 19 تكرارًا ترادفيًا قصيرًا من منطقة 15q11-q13 حذفًا مشتقًا أبويًا للعديد من المواقع الإعلامية (على سبيل المثال ، D15S817 ، D15S63 ، D15S210 ، جبرا 5، D15S822) لدعم نقاط التوقف عند BP2 و BP3. ومن المثير للاهتمام ، أن لديها ثلاثة أليلات في D15S541 و D15S542 و D15S1035 ، وهي مركزية لكسر BP2 داخل المنطقة 15q11-q13 ، مما يشير إلى تكرار هذه المواقع (الجدول 1). تمت مشاركة نفس الازدواجية من قبل والدها وأعمامها الطبيعيين من خلال تحليل تفاعل البوليميراز المتسلسل ولكن ليس من قبل الأخوين غير المتأثرين. لم يُظهر أي شخص آخر تم اختباره في العائلة الحذف أو الازدواجية (الجدول 1).


الحذف والازدواجية القريبة من ملف خارجي 1 الجين: آلية مسببة جديدة للعظم الغضروفي المتعدد †

بدعم من: المنظمة الهولندية للبحث العلمي ، رقم المنحة: 917-76-315 (إلى CJFW و CMAR و JVMGB) الشبكة الأوروبية للتميز EuroBoNet ، رقم المنحة: 018814 (LSHC-CT-2006-018814) (إلى CJFW ، MGTW و DdJ و JVMGB و KS).

الملخص

العظمية الغضروفية المتعددة (MO) هي متلازمة تتطور فيها الأورام الحميدة المغطاة بالغضروف على سطح العظام الطويلة. معظم الحالات ناتجة عن تغييرات خارجية في خارجي 1 أو EXT2، لكن 15٪ سلبيون لهذه التغييرات. هنا نبلغ للمرة الأولى عن عائلة من مرضى MO يعانون من تغيرات جينومية في السلالة الجرثومية في خارجي 1 الموقع بدون طفرات يمكن اكتشافها أو تغييرات في رقم النسخ تحويلة متواليات exonic. أظهر Array-CGH حذف 80.7 كيلو بايت من Intron 1 من خارجي 1 و 68.9 كيلوبايت القريبة من الازدواجية خارجي 1. حددنا نقطة توقف بين النهاية البعيدة للمنطقة المكررة والتسلسل البعيد للمنطقة المحذوفة في الإنترون الأول. كانت نقطة التوقف هذه غائبة في أفراد الأسرة غير المتأثرين. يشير تكوين نقطة التوقف إلى إدخال مباشر للمنطقة المكررة في الحذف. However, no other breakpoint was found, which suggests a more complex genomic rearrangement has occurred within the duplicated region. Our results reveal intronic deletion and duplication as a new causative mechanism for MO not detected by conventional diagnostic methods. © 2013 Wiley Periodicals, Inc.



تعليقات:

  1. Faulabar

    برأيي أنك أخطأت. اكتب لي في PM ، سنتحدث.

  2. Arabei

    في هذا السؤال ، قل أن الأمر قد يستغرق وقتًا طويلاً.

  3. Tessema

    إجابة سريعة للغاية :)

  4. Grojin

    في رأيي موضوع مثير للاهتمام للغاية. عرض الجميع المشاركة بنشاط في المناقشة.



اكتب رسالة