معلومة

تأثير اختيار الخلفية على مناطق المروج مقارنة بالمحسّنات البعيدة؟

تأثير اختيار الخلفية على مناطق المروج مقارنة بالمحسّنات البعيدة؟



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

هل نظر أي شخص إلى تأثير اختيار الخلفية على مستويات الحفاظ على مناطق المحفز مقارنة بالمحسّنات البعيدة؟ هل تتمتع مناطق المحفز بدرجة حفظ أعلى بسبب اختيار الخلفية من الجينات القريبة مقارنة بمناطق المحسن البعيدة؟

أعطتني محاولاتي للبحث في Google لهذا الغرض فقط ورقة بحثية عام 2004 عن ذبابة الفاكهة حول عدد قليل من مسح الجينات:

http://mbe.oxfordjournals.org/content/21/2/374.full

أتساءل عما إذا كان قد تم النظر في هذا من قبل أو إذا كان هناك أي أجزاء أخرى ذات صلة من الجينات يجب على المرء أن يأخذها في الاعتبار أولاً.

تحرير: مزيد من الشرح في الفرضية أدناه ، ومرجع يمكن أن يكون مفيدًا:

لنبدأ بافتراض منطقة قريبة من جين مشفر يمكن أن تكتسب إمكانات تنظيمية عبر طفرة نقطية جديدة أو إزاحة صغيرة. يجب اختيار هذه الإمكانات التنظيمية الجديدة بشكل إيجابي بعد ظهورها ، أو أنها ستتراكم تدريجياً المزيد من الطفرات وتختفي. ولكن إذا كانت المنطقة قريبة بما يكفي من الجين المشفر ، فإن معدل إعادة التركيب بين المنطقة وجسم الجين القريب سيكون منخفضًا ، متناسبًا مع المسافة بينهما. إذا افترضنا أن الجسم الجيني يخضع لقيود انتقائية ، فسيكون هناك تأثير اقتحام للمنطقة التنظيمية القريبة بواسطة الجين القريب. ستكون مستويات الخلفية للطفرة في المنطقة التنظيمية أقل (طفرة خلفية أقل) منها في منطقة ليست قريبة من الجين تحت قيود انتقائية قوية. لذا فإن إحدى الطرق لشرح سبب الحفاظ على مناطق المروج / المُحسِّن القريبة أكثر من مناطق المُحسِّن البعيدة ستكون ببساطة بسبب الارتباط.

سيكون الجزء الثاني من الفرضية حول وجود أو عدم وجود نقاط ساخنة لإعادة التركيب في مناطق المنبع لمنطقة الترميز: إذا تم الاحتفاظ بالمروج / المعززات القريبة عبر الارتباط بأقرب جين ، مقاييس غير متحيزة للتقاطع (مثل تجارب PRDM9 في الماوس الخصية) يجب أن تشير إلى ما إذا كان هناك ارتباط متزايد للكتل الجينومية الوظيفية ، مثل كتل المحسن / المحفز / الجينات (بيانات Hi-C ، 4C ، 3C) ، بينما إذا لم تلعب إعادة التركيب دورًا ، فلن تكون الكتل التنظيمية بالضرورة أبقى في نفس كتلة النمط الفرداني.